Фільм розпочинається із загадкового зникнення приватного детектива Гаррі Гудмана. Після цього його 21-річному синові Тіму належить з’ясувати, що сталось з батьком. У цьому Тімові допоможе Покемон детектив Пікачу, милий та мудрий дотепник, який часом є загадкою навіть для себе самого.
Тім та Пікачу разом вирушають у неймовірну пригоду. Вони шукають ключ до розгадки у неоновому мегаполісі Райм-сіті, де люди та Покемони живуть пліч-о-пліч. Тім та Пікачу знайомляться з різними Покемонами та дізнаються шокуючу правду, здатну покласти край мирному співіснуванню та поставити під загрозу весь світ Покемонів.